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細菌儲存系統

coolcd
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1subject: 細菌儲存系統Promote 0 Bookmark 02010-11-27quote  

香港科学家在1克细菌中储存90GB数据

詳情可看 Hong_Kong-CUHK.pdf,從原理來說,它是將字母用 ASCII 編碼,將 ASCII 數字轉成由 0123 的四進位數字,再把 0123 與 DNA 的 ATCG 對應。

這會遇到一些技術問題,如:資料量可能超過可插入的 DNA 大小、現有 DNA 合成技術的限制,所以必須將資料分段處理。這會有資料定位的問題,所以資料片段必需加上 header 以便重組。

1g 的細菌有一千萬個細胞,如果一個細胞可以放 1kb 的資料,資料容量將會非常可觀、輕便,而且細胞內也可以有大量的重覆片段,可保護資料的完整性。

個人認為這非常有意思,但也有極大隱憂,誰知道儲存在 DNA 中的資料,會不會有特異的生理功能?成為超級細菌?即使加上防護性的 DNA 片段,也難保 DNA 不會破碎釋出?

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eliu

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只是DNA如何封裝&穩定度、耐久度如何是一大問題。

coolcd
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eliu

只是DNA如何封裝&穩定度、耐久度如何是一大問題。

原來日本慶應大學更早就有相關研究:把資料存儲在細菌DNA

...

負責這項研究的慶應大學富田勝教授表示,墨水會褪色、電腦可能破損,而細菌上儲存的訊息可長久保存, 直到細菌的生命期限,有可能延續100萬年。

富田勝教授的研究隊伍成功的把愛因斯坦著名的「E=mc2」方程、和愛因斯坦發表狹義相對論的年分1905, 插入到一種常見細菌的DNA中。

遺傳編碼的容量巨大,比方說一本莎士比亞的劇本可以儲存在基因的某個很小的部份,而不會影響一個活體組織的整體外觀和其它特性。

但基因的突變可能損壞存儲的資料。富田勝教授說資料儲存在細菌的4個地方,資料可保持完整。而九州大學教授細菌專家土居克實則持懷疑態度。

不過這次香港中大是把大腸桿菌當成有加解密功能的大容量儲存系統。

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eliu

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問題是有這種 sensor 可以讀 DNA 嗎?

DNA sequencing

裏面的方法看起來不適合

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coolcd
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我想目前細菌儲存系統應該還是很初期的概念而已,能夠正確讀取、拼湊、解密出細菌內加密的資料,就很厲害了,讀取效率可能日後才會發展新技術來改善吧。

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